两个人都持有店铺50%的股份，如何公平地分配店

利润应按约定或出资比例分配。依据《公司法》，股东通常按实缴出资比例分红，有约定则依约定。不及时处理可能导致股东间矛盾升级，影响店铺运营。
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常见处理方式为按约定或出资比例分红。有特别约定遵约定，无则按实缴出资比例分配，确保公平合理。
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按约定或出资分红。操作如下：1.查阅股东协议，有无特殊分红约定；2.无约定，则按实缴出资比例计算各自应得利润；3.确保公司先弥补亏损并提取法定公积金；4.按计算结果公平分配利润给两位股东。